TY - RPRT TI - Comprehensive benchmarking of somatic single-nucleotide variant and indel detection at ultra-low allele fractions using short- and long-read data AU - Ha, Y.-J. J. AU - Maziec, D. AU - Markowski, J. AU - Georges, S. J. AU - Parmalee, N. L. AU - Berselli, M. AU - Coorens, T. H. AU - Dong, S. AU - Gardiner, S. AU - Kalra, D. AU - Li, D. AU - Miao, B. AU - Musunuri, R. AU - Xue, L. AU - Yu, Z. AU - Walker, K. AU - Anderson, L. AU - Au, N. Y. AU - Cibulskis, C. AU - Doddapaneni, H. AU - Grochowski, C. M. AU - Jensen, D. M. AU - Lindsay, T. AU - Loy, K. AU - Narayan, A. AU - Narzisi, G. AU - Ou, J. AU - Pham, M. M. AU - Runnels, A. M. AU - Stergachis, A. B. AU - Sutherlin, L. M. AU - Wang, T. AU - Jin, H. AU - Feng, W. C. AU - Zhang, Y. AU - Veit, A. D. AU - Kim, C. T. AU - Chun, H.-J. E. AU - Ardlie, K. AU - Fulton, R. S. AU - Germer, S. AU - Gibbs, R. A. AU - Marth, G. T. AU - Bennett, J. T. AU - Park, P. J. PY - 2025 DO - 10.1101/2025.10.13.681545 UR - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.10.13.681545v1 ID - 10.1101/2025.10.13.681545 ER -